美国联邦政府正走向部分停摆的边缘，公共服务和经济都将受到广泛影响。员工被迫休假和潜在裁员将导致部分政府活动停止，但NASA太空任务、特朗普(Donald Trump)的移民打击行动以及FDA和农业部的某些公共卫生工作将继续进行。
国土安全部的大部分员工将继续工作，因为该部门大量人员从事执法工作或在由用户费用而非国会拨款支持的领域工作。该部门在其网站发布的计划显示，约27.1万名员工中约有1.4万人将在政府停摆时被迫休假。海关与边境保护局、移民与海关执法局、运输安全管理局、公民与移民服务局以及联邦紧急事务管理局等部门的绝大多数官员和员工将继续工作。
为特朗普提供特勤局保护、处理入境货物和乘客以及执行移民执法行动等活动将继续进行。Medicare和Medicaid项目和服务也将继续不间断运行，尽管人员短缺可能导致某些服务延迟，比如Medicare卡的邮寄。政府有足够资金支持Medicaid到下一财年第一季度。符合条件的州将继续获得儿童健康保险计划的款项。
虽然联邦紧急措施署（FEMA）的核心灾难救援功能短期内不会受影响，但该机构其他工作将受到冲击。一些拨款审批将暂停，国家洪水保险计划下无法制定新政策，导致需要洪水保险的新抵押贷款陷入停滞。但延长的停摆可能在最坏情况下耗尽FEMA现有的灾难救援基金，该基金目前约有100亿美元。众议院议长迈克·约翰逊(Mike Johnson)周一在白宫警告说，FEMA在停摆期间"不会获得资金"。
已经获得认证并在岗的空中交通管制员将成为继续工作的基本人员，但他们的薪水可能受到影响。全国空中交通管制员协会主席尼克·丹尼尔斯(Nick Daniels)表示，无薪工作给本就从事困难工作的管制员增加了压力。他说在过去的停摆中，一些管制员甚至不得不找兼职来帮助支付账单。
航空公司飞行员协会主席杰森·安布罗西(Jason Ambrosi)机长敦促国会达成协议，称停摆威胁世界上最安全航空系统的稳定性。然而，俄克拉荷马城培养空中交通管制员的学校将关闭，学生将被送回家，这损害了政府解决该职业严重短缺问题的努力。培训中断可能促使一些人转而追求不同职业，使全国范围内消除3000名管制员短缺变得更加困难。停摆还可能推迟耗资数十亿美元的空中交通管制设备改造和现代化工作。
在亚特兰大的疾病控制与预防中心，超过半数员工将被迫休假。仍在工作的人包括处理传染病暴发、照料研究动物和维护实验室的人员。联邦官员表示CDC将继续监测疾病暴发。将停止的活动包括健康风险研究和疾病预防方法、与公众的沟通，以及帮助州和地方官员预防药物过量死亡或其他健康问题的工作。
国立卫生研究院的研究和患者护理将受到颠覆。目前在被称为"希望之屋"的纯研究医院注册的患者将在政府停摆期间继续获得护理。但希望获得实验性疗法的其他病人除特殊情况外无法入组，新研究也不会开始。科学家面临昂贵的实验室研究付诸东流的前景，因为这个国家顶级医学研究机构的庞大校园大部分将清空。
约四分之三的NIH员工将被迫休假。仍在工作的包括医院工作人员以及负责安全或动物护理的人员。还有连锁效应，因为NIH资助全国各地大学和其他机构的基础研究和临床试验，虽然现有拨款不受影响，但该机构无法批准任何待处理的申请。
FDA的大部分核心职责将继续，包括应对公共卫生威胁、管理产品召回和药物短缺。一些常规活动，包括先前安排的公司制造工厂检查，将被停止。但当该机构有理由怀疑可能危及消费者的问题时，将继续进行检查。确保食品供应即时安全的政府活动将继续，包括食品召回、调查和进口检查。但长期食品安全工作，包括旨在减少食源性疾病的举措，将被暂停。
根据政府停摆计划，约86%的FDA员工将继续工作，因为他们的工作被视为必不可少或由非联邦来源资助。审查药品、医疗器械和烟草产品的FDA科学家主要或完全由公司费用资助，而非联邦政府。
国务院预计将迫使超过半数留在美国的直接雇用人员休假，尽管海外使领馆将保持开放并为美国公民提供服务。预计不会有永久性裁员。根据周一发布在其网站上的71页计划，该部门表示，在2.7万名国内雇员中，只有1.034万名被认为从事必要工作的员工将免于停摆休假。被视为停摆计划"例外"的员工是那些工作对应对紧急情况和国家安全必要的人。
环保署表示，政府停摆应急计划将让超过10%的员工留在岗位上处理法律要求或保护生命和财产所必需的"重要机构活动"。将继续的活动包括保护EPA土地、建筑物、设备和正在进行的研究，以及执法和刑事调查以及紧急和灾难援助。某些超级基金清理场地的响应工作也将继续，特别是在不维持运营会对人类生命构成紧迫威胁的情况下。
如果停摆从周三开始，超过1700名员工将被要求去工作。当特朗普1月开始第二任期时，该机构约有1.5万名员工，但作为特朗普和亿万富翁埃隆·马斯克(Elon Musk)缩减联邦劳动力更广泛努力的一部分，已经裁减了数百名员工，并向数千人提供自愿退休或延迟辞职。特朗普提出的EPA预算显示，预计在周三开始的预算年度将有1.286万名员工。